Государственную регистрацию индивидуальных предпринимателей осуществляет Национальный статистический комитет Кыргызской Республики и его территориальные органы (регистрирующие органы) по месту их жительства в соответствии с Положением о порядке государственной регистрации граждан, занимающихся предпринимательской деятельностью без образования юридического лица в качестве индивидуального предпринимателя на территории Кыргызской Республики, утвержденным постановлением Правительства Кыргызской Республики от 2 июля 1998 года №404.

Государственная регистрация индивидуальных предпринимателей носит заявительный характер и заключается в постановке их на учет в качестве хозяйствующего субъекта, выдаче им свидетельства о государственной регистрации с присвоением общереспубликанского идентификационного кода и их включением в Единый государственный регистр статистических единиц.

Органы государственной статистики осуществляют ведение государственного регистра индивидуальных предпринимателей, формирование единого банка данных индивидуальных предпринимателей, расположенных на территории Кыргызской Республики, получение и передачу информации созданных и прекративших деятельность индивидуальных предпринимателей.